Pithovirus
Pithovirus är ett genus av jättevirus som infekterar amöbor. Det är ett dubbelsträngat DNA-virus och tillhör kladen av stora DNA-virus. Det beskrevs första gången 2014 efter att ett livskraftigt exemplar hittats i en 30 000 år gammal iskärna som tagits från permafrost i Sibirien, Ryssland.
Det är 50 procent större än de tidigare största kända virusen, men Pandoravirus har det största virusgenomet, som innehåller 1,9-2,5 megabaser av DNA. Pithovirus har en tjock, oval vägg med en öppning i ena änden. Internt liknar dess struktur en honungskaka.
Dess genom
Pithovirusets arvsmassa består av 467 olika gener, vilket är mer än ett typiskt virus men betydligt mindre än Pandoravirus. Dess genom är mycket mindre tätt packat än något annat känt virus. Två tredjedelar av dess proteiner skiljer sig från andra virus. Trots den fysiska likheten med Pandoravirus visar Pithovirus genomsekvens att det knappt är besläktat med det viruset. Det liknar mer medlemmar av vissa andra virusfamiljer. Dessa familjer innehåller alla stora isosaedriska virus med DNA-genom. Pithovirusgenomet har 36 % GC-innehåll, vilket liknar Megaviridae, i motsats till mer än 61 % för pandoravirus.
Replikering
Pithovirus' genom är en cirkulär, dubbelsträngad DNA-kromosom (dsDNA) med cirka 610 000 baspar (bp). Dess DNA översätts till 467 olika proteiner. Genomet kodar för alla de proteiner som behövs för att producera mRNA; dessa proteiner finns i de renade virionerna.
Pithoviruset gör hela sin replikationscykel i värdets cytoplasma, och inte på det mer typiska sättet genom att ta över värdets kärna.
Upptäckt
Pithovirus sibericum upptäcktes i ett 30 000 år gammalt prov från sibirisk permafrost. Viruset upptäcktes begravt 30 meter under ytan i ett senpleistocent sediment. Det hittades när prover från flodbankar som samlades in år 2000 exponerades för amöbor. Amöborna började dö och visade sig innehålla jättevirus. Författarna sade att de fick idén att undersöka permafrostprover för att hitta nya virus efter att ha läst om ett experiment som återupplivade ett liknande åldrande frö två år tidigare.
Även om viruset är ofarligt för människor har dess livskraft efter att ha varit fryst i årtusenden väckt oro för att globala klimatförändringar och borrning på tundran kan leda till att potentiellt farliga virus grävs upp. Andra forskare förnekar att detta utgör ett verkligt hot.
