Genom
En organisms genom är hela dess arvsmassa som är kodad i dess DNA (eller, för vissa virus, RNA). Detta omfattar både generna och de icke-kodande sekvenserna i DNA. Professor Hans Winkler myntade begreppet 1920.
Winklers definition, i översättning, lyder:
"Jag föreslår uttrycket genom för den haploida kromosomuppsättningen, som tillsammans med den tillhörande protoplasman anger den materiella grunden för arten ....". p165
Ingen haploid kromosomuppsättning definierar dock ens en arts DNA. På grund av den enorma variation av alleler som finns i en population är varje individ genetiskt annorlunda. Till och med en diploid individ bär på genetisk variation. Därför föredrog Dobzhansky "kromosomuppsättning", och definitionen måste nu vara bredare än Winklers definition. Genomet i en haploid kromosomuppsättning är bara ett urval av den totala genetiska variationen hos en art.
Termen "genom" kan användas specifikt för att beteckna hela kärnans DNA (kärngenomet), men kan också användas för organeller som innehåller eget DNA, till exempel mitokondriernas eller kloroplasternas genom.
Storlekar på genomet
| Organism | Genomstorlek (baspar) | Obs |
| Virus, bakteriofag MS2 | 3569 | Första sekvenserade RNA-genomet |
| Virus, SV40 | 5224 | |
| Virus, Phage Φ-X174 | 5386 | Första sekvenserade DNA-genomet |
| Virus, fager λ | 5×10 4 | |
| 1.6×10 5 | Det minsta icke-virala genomet, februari 2007 | |
| Bakterie, Escherichia coli | 4×10 6 | Bäst utforskad bakterie. |
| Bakterie, Solibactoer usitatus | 1×10 7 | Största kända bakteriegenom |
| Protist, Amoeba dubia | 6.7×10 11 | Största kända arvsmassa, men den är omtvistad. |
| Växt, Arabidopsis thaliana | 1.57×10 8 | Första växtgenomet sekvenserat, december 2000. |
| Växt, Genlisea margaretae | 6.34×10 7 | Den minsta registrerade blommande växtgenomet, 2006. |
| Växt, Fritillaria assyrica | 1.3×10 11 | |
| Växt, Populus trichocarpa | 4.8×10 8 | Första trädgenom, september 2006 |
| Jäst, Saccharomyces cerevisiae | 2×10 7 | |
| Svamp, Aspergillus nidulans | 3×10 7 | |
| Nematod, Caenorhabditis elegans | 9.8×10 7 | Det första flercelliga djurets arvsmassa, december 1998. |
| Insekt, Drosophila melanogaster (fruktfluga) | 1.3×10 8 | |
| Insekt, Bombyx mori, även kallad silkesfjäril. | 5.30×10 8 | |
| Insekt, Apis mellifera aka honungsbi | 1.77×10 9 | |
| Fisk, Tetraodon nigroviridis, typ av kuffertfisk | 3.85×10 8 | Det minsta kända genomet för ryggradsdjur |
| 3×10 9 | ||
| Fisk, Protopterus aethiopicus aka marmorerad lungfisk | 1.3×10 11 | Största kända arvsmassa för ryggradsdjur |
Observera: DNA från en enda mänsklig cell har en längd på ~1,8 m (men en bredd på ~2,4 nanometer).
Relaterade sidor
- Gene
- Analys av sekvenser
- Det mänskliga genomet
- ENCODE: den fullständiga analysen av det mänskliga genomet
Frågor och svar
F: Vad är ett genom?
S: Ett genom är hela den ärftliga informationen i en organisms DNA (eller, för vissa virus, RNA). Detta omfattar både generna och de icke-kodande sekvenserna i DNA.
F: Vem myntade begreppet "genom"?
S: Professor Hans Winkler myntade begreppet "genom" 1920.
F: Vad definierade Winkler som ett genom?
S: Winkler definierade ett genom som "den haploida kromosomuppsättningen, som tillsammans med den tillhörande protoplasman anger artens materiella grundvalar".
F: Har varje individ en genetisk variation?
Svar: Ja, på grund av de alleler som bärs av en population är varje individ genetiskt annorlunda. Även diploida individer bär på genetisk variation.
F: Vad betyder det när vi säger "kärngenom"?
S: När vi talar om "kärngenom" avses specifikt den fullständiga uppsättningen kärn-DNA.
F: Finns det andra genomer än kärngenom?
Svar: Ja, det finns även mitokondriella genomer och kloroplastgenomer som innehåller eget DNA.
