Stillwater är en stad i Washington County, Minnesota. Den ligger vid floden St. Croix, mittemot delstaten Wisconsin. Befolkningen uppgick till 18 225 personer vid 2010 års folkräkning. Det är länets huvudort. Stillwater är en del av Twin Cities Metro Area.
Den 29 juli och 29 september 1837 undertecknades fördrag mellan USA:s regering och de lokala Ojibwa- och Dakota-folken. De tillät bosättning i St. Croix River Valley. Staden grundades av nybyggare som lockades av områdets då rikliga timmer- och flodtrafik. Det är en av Minnesotas äldsta städer och föregår Minneapolis med flera år. Stillwater blev officiellt införlivad som stad den 4 mars 1854 (samma dag som St. Paul). Staden fick sitt namn efter det lugna vattnet i floden St. Croix.
Stillwater kallas ofta för Minnesotas födelseplats. År 1848 hölls i Stillwater en territoriell kongress som inledde processen för att bilda Minnesota som stat. Konventet valde ut tre ledande städer i Minnesota som platser för tre viktiga offentliga institutioner. Minneapolis fick University of Minnesota, Saint Paul blev huvudstad och Stillwater valdes som plats för territoriets första fängelse. Minnesota Territorial Prison öppnades 1853.
Timmerindustrin var den viktigaste industrin i St. Croix River Valley under andra hälften av 1800-talet. Under många år skickades timmerstockar nedför floden St. Croix, samlades in vid St. Croix Boom Site två mil uppströms Stillwater och bearbetades i Stillwaters många sågverk. Ångbåtarna användes mest från 1860 till 1890, och några används fortfarande för underhållning i dag.
Stillwater skickade män från 1st Minnesota Volunteer Infantry Company B och 8th Minnesota Volunteer Infantry Regiment Company C till det amerikanska inbördeskriget.
