Syntetisk genomik
Syntetisk genomik är en typ av genteknik. Man tillverkar gener som aldrig förekommer i naturen.
Syntetisk genomik använder inte naturligt förekommande gener. Den kan använda skräddarsydda basparserier. I framtiden kan den använda genetiska koder som inte består av de två baspar av DNA som för närvarande används av livsformer.
Syntetisk genomik använder tekniker från genetisk forskning. Forskarna kan tillverka långa basparkedjor billigt och exakt i stor skala. Detta gör det möjligt för dem att göra experiment på genomer som inte finns i naturen. De använder sig också av idéer om proteinveckning och avancerade datoranläggningar.
J. Craig Venter Institute arbetar på detta område. Teamet med cirka 20 forskare leds av Nobelpristagaren Hamilton Smith, DNA-forskaren Craig Venter och mikrobiologen Clyde A. Hutchison III. Venter-gruppen har satt ihop ett halvsyntetiskt bakteriegenom för Mycoplasma genitalium genom rekombination av 25 överlappande fragment. Detta gjordes i ett enda steg:
"Användningen av rekombination i jäst förenklar avsevärt sammansättningen av stora DNA-molekyler från både syntetiska och naturliga fragment".
Genetiker har skapat den första syntetiska kromosomen för jäst. "Generna i den ursprungliga kromosomen ersattes med syntetiska versioner och den färdiga konstgjorda kromosomen integrerades sedan framgångsrikt i en jästcell".
Andra företag, bland annat Synthetic Genomics (företaget), har bildats för att dra nytta av de många kommersiella användningsområdena för specialkonstruerade genomer.
Frågor och svar
F: Vad är syntetisk genomik?
S: Syntetisk genomik är en typ av genteknik som skapar gener som inte förekommer i naturen. Den använder inte naturligt förekommande gener utan kan i stället använda skräddarsydda basparserier.
F: Hur fungerar syntetisk genomik?
S: Syntetisk genomik använder tekniker från genetikforskningen för att skapa långa basparkedjor billigt och noggrant i stor skala. Detta gör det möjligt för forskare att experimentera med genomer som inte finns i naturen. Idéer från proteinveckning och avancerade datoranläggningar används också.
Fråga: Vem leder forskningen på detta område?
S: J. Craig Venter-institutets grupp på cirka 20 forskare leds av Nobelpristagaren Hamilton Smith, DNA-forskaren Craig Venter och mikrobiologen Clyde A. Hutchison III.
F: Vad har Venter-gruppen åstadkommit hittills?
S: Venter-gruppen har satt ihop ett halvsyntetiskt bakteriegenom för Mycoplasma genitalium genom rekombination av 25 överlappande fragment i ett enda steg med hjälp av rekombinationsteknik för jäst. Dessutom har genetikerna tillverkat den första syntetiska kromosomen för jäst genom att ersätta generna i den ursprungliga kromosomen med syntetiska versioner och integrera den framgångsrikt i en jästcell.
F: Finns det några kommersiella tillämpningar för specialdesignade genomer?
S: Ja, företag som Synthetic Genomics har bildats för att dra nytta av de många kommersiella användningsområdena för specialdesignade genomer.
F: Vilken typ av experiment kan göras med syntetisk genomik?
S: Experiment kan göras på genomer som inte finns i naturen med hjälp av tekniker för syntetisk genomik, t.ex. genom att skapa långa basparkedjor billigt och exakt i stor skala eller genom att rekombinera 25 överlappande fragment i ett enda steg med hjälp av rekombinationsteknik för jäst.