Maclyn McCarty (9 juni 1911 - 2 januari 2005) var en amerikansk genetiker. Han var mest känd för att ha bevisat att DNA, och inte protein, var den kemiska grunden för genen.

McCarty ägnade sitt liv åt att studera smittsamma organismer. Studier av bakterier ledde till studier av arv genom genetik och biokemi. Detta inledde molekylärbiologins tidsålder.

McCarty var den yngsta och längst överlevande medlemmen av forskargruppen som ansvarade för Avery-MacLeod-McCarty-experimentet. Han fick Wolf-priset i medicin 1990. MacCarty avled den 2 januari 2005 i hjärtsvikt.