En kromofor är den del av en molekyl som är ansvarig för dess färg.

Färgen uppstår när en molekyl absorberar vissa våglängder av synligt ljus. Den släpper igenom eller reflekterar endast andra våglängder, vilket ger den färg vi ser.

I biologiska molekyler som fångar eller upptäcker ljusenergi är kromoforen den del av molekylen som reagerar när den träffas av ljus.

Kromoforer skapar färgen i kromatofoner, som är pigmentinnehållande och ljusreflekterande celler som finns i många djur.