Metroid Prime Hunters är ett actionäventyr i första person för Nintendo DS-konsolen. Det utvecklades av Nintendo Software Technology och publicerades av Nintendo. Det släpptes i Nordamerika den 20 mars 2006, i Europa den 5 maj 2006 och i Japan den 1 juni 2006. När Nintendo DS lanserades 2004 innehöll den en tidig demo av Metroid Prime Hunters, som då hette Metroid Prime Hunters: First Hunt.
Liksom andra titlar i Metroid Prime-serien är Metroid Prime Hunters ett äventyrsspel i första person där fokus ligger på utforskning och upptäckter. Det skiljer sig dock från de andra titlarna genom att det inte finns något assisterat sikte, ett större fokus på spelupplevelsen och flerspelare online. Samus Aran, huvudpersonen som spelaren spelar som, kan få tillgång till sitt vapen skepp var som helst. Spelet använder båda skärmarna på Nintendo DS: den övre skärmen används för att visa Samus hälsa och hur mycket av ett vapen som finns kvar, medan den nedre skärmen visar radarn. Spelaren förflyttar Samus med D-padden, och sikten sker med hjälp av pekskärmen på Nintendo DS:s nedre skärm.
Du kan spela online med upp till fyra spelare. Spelarna kan spela som Samus eller en av sex prisjägare. Varje prisjägare har olika former och vapen. Spelvärden kan ställa in alternativ för poäng och tidsgränser samt bestämma om spelarna kan använda radarn eller inte. Om färre än fyra spelare deltar i ett spel placeras datorstyrda karaktärer in i spelet. I flerspelarläget visar den nedre skärmen hur många dödade en spelare har gjort och hur lång tid som återstår av rundan.