Hertigdömet Sachsen-Jena var ett av de ernestinska hertigdömena i huset Wettin.

En del av hertigdömet Sachsen-Weimar gavs 1672 till Bernhard, fjärde sonen till Wilhelm, hertig av Sachsen-Weimar. Den andra hertigen hade inga manliga arvingar som kunde ärva titeln, så territoriet togs tillbaka av Sachsen-Weimar när den andra hertigen dog 1690. .