Stephen Jay Gould (10 september 1941-20 maj 2002) var en amerikansk paleontolog, evolutionsbiolog, taxonom och vetenskapshistoriker.
Han var också en av de mest inflytelserika och lästa populärvetenskapliga författarna i sin generation.
Gould tillbringade större delen av sin karriär med att undervisa vid Harvard University och arbeta vid American Museum of Natural History i New York. Under de sista åren av sitt liv undervisade Gould också i biologi och evolution vid New York University nära sitt hem i SoHo.
Goulds största bidrag till vetenskapen var teorin om punktuell jämvikt, som han utvecklade tillsammans med Niles Eldredge 1972. Teorin föreslår att den mesta evolutionen kännetecknas av långa perioder av evolutionär stabilitet, som avbryts av sällsynta fall av förgrenad evolution. Teorin ställdes mot idén att evolutionär förändring kännetecknas av ett mönster av jämn och kontinuerlig förändring i fossilregistret.
Den största delen av Goulds empiriska forskning baserades på snigelsläktena Poecilozonites och Cerion. Han bidrog också till evolutionär utvecklingsbiologi och har fått mycket beröm för sin bok Ontogeny and Phylogeny. Inom evolutionsteorin motsatte han sig strikt selektionism, sociobiologi tillämpad på människor och evolutionär psykologi. Han drev en kampanj mot kreationism.
Många av Goulds naturhistoriska essäer trycktes om i samlade volymer.