Databas över molekylära rörelser
Database of Macromolecular Motions är en bioinformatisk databas på Internet. Den försöker dela in rörelser av biologiska protein- och vissa RNA-molekyler i olika typer.
Beskrivning
Den tillverkades ursprungligen av Mark B. Gerstein, Werner G. Krebs och Nat Echols i gruppen för molekylär biofysik och biokemi vid Yale University. Människor kan använda en Internetsida för att söka i denna datadatabas efter en viss rörelse genom antingen proteinnamnet eller Protein Data Bank-numret. Många människor hittar dock denna datadatabas genom att bara komma över från Internetsidan för proteingången i Protein Data Bank. För proteiner som finns i båda datordatabaserna ger denna olika datordatabas ofta en länk tillbaka till internetsidan för proteinet på denna webbplats.
Datadatabasen innehåller ett Internetverktyg eller gratis programvara som tjänst (Morph-servern) som gör det möjligt för icke-experter att se vissa proteinrörelser genom att skapa korta rörliga bilder. Rörelsebilderna skapas automatiskt med hjälp av dataprogrammet på Internetplatsen. När de är färdiga skickar webbplatsen ett e-postmeddelande med information om rörliga bilder till användaren.
Verktyget "Morph Server" var ursprungligen ett forskningsverktyg snarare än ett verktyg för att göra filmer, och erbjöd därför endast begränsad kontroll över rendering, färg och synvinkel, och den ursprungliga metoden krävde ibland en hel del datortid för att slutföra. Sedan webbplatsens första introduktion 1996 har webbplatsen förbättrats för att försöka åtgärda vissa av dessa problem samt lägga till nya saker. Andra personer har nu gjort alternativa system, till exempel MovieMaker från University of Alberta.
