Tandemrepetition

Tandemrepetitioner uppstår i DNA när ett mönster av nukleotider upprepas. Upprepningarna sitter bredvid varandra, i tandem. Det är flera kopior av samma basparsekvens som ligger sida vid sida.

Ett exempel skulle kunna vara: I detta exempel upprepas sekvensen ATTCG ATTCG ATTCG tre gånger.

 

Terminologi

Om mellan 10 och 60 nukleotider upprepas kallas den för en minisatellit. De med färre är kända som mikrosatelliter eller "korta tandemrepetitioner".

När exakt två nukleotider upprepas kallas det för en dinukleotidupprepning (till exempel: ACACACACACAC...).

När tre nukleotider upprepas kallas det en trinukleotidupprepning (till exempel: CAGCAGCAGCAGCAGCAGCAG...). Avvikelser i sådana områden kan ge upphov till störningar med trinukleotidrepetitioner.

Kopieringsnumret för den upprepade enheten kan vara varierande. Detta är en tandemrepetition med variabelt antal (VNTR).

 

Använder

Ett tandemupprepningsmönster hjälper till att fastställa en individs ärftliga egenskaper. Tandemrepetitioner kan vara mycket användbara för att fastställa släktskap. Korta tandemrepetitioner används för vissa genealogiska DNA-tester.

Vid genetiska fingeravtryck och DNA-profilering undersöks DNA från tandemrepetitioner i kromosomalt DNA.

 

Referens

1.      Burt A. & Trivers R. 2006. Gener i konflikt: biologin hos själviska genetiska element. Harvard University Press. "Tandemrepeater" s364/6 & s582.

2.      "Kopior av basparsekvenser kan upprepas efter varandra längs en kromosom: till exempel 40S rRNA-gener i somatiska celler hos paddor, av vilka det finns cirka 500 kopior". Anpassat från Biology-Online.org [1]

3.      Tandemrepeat på US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH) [2]

4.      Alberts, Bruce et al 2002. Cellens molekylärbiologi. Garland, G31.

 

AlegsaOnline.com - 2020 / 2023 - License CC3