Hugo Gene Nomenclature Committee (HGNC

HUGO Gene Nomenclature Committee (HGNC) fastställer ett unikt och meningsfullt namn för varje känd mänsklig gen. Den frågar experter om deras åsikter. HGNC ger varje gen ett långt namn och en förkortning (en symbol). HGNC är en del av Human Genome Organisation (HUGO).

Traditionella gennamn och förkortningar är ofta inte specifika för en enskild gen. Exempel: CAP (som bara betyder "kromosomassocierat protein") kan hänvisa till någon av sex olika gener: (BRD4, CAP1, LNPEP, PTPLA, SERPINB6 och SORBS1).

Till skillnad från traditionella namn som CAP ges HGNC:s korta gennamn, eller gensymboler, endast till en gen. Detta minskar förvirringen om vilken gen som avses.

Riktlinjer för namngivning

HGNC:s tillvägagångssätt för att namnge gener och tilldela symboler (gennamnsförkortningar) är:

Gen-symbolerna måste vara unika.
Symboler ska endast använda det romerska alfabetet och arabiska siffror.
Symboler får inte innehålla interpunktion eller "G" för gen.
symbolerna inte innehåller någon hänvisning till den art de är kodade i, dvs. "H/h" för människa

En fullständig beskrivning av HGNC:s riktlinjer för nomenklatur finns på deras webbplats [2]. HGNC förespråkar appendixen _v1, _v2,... för att skilja mellan olika skarvvarianter och _pr1, _pr2,... för promotorvarianter av en enskild gen.

HGNC anger också att "gen-nomenklaturen bör utvecklas i takt med ny teknik snarare än att vara restriktiv, vilket ibland sker när historiska och enskilda gen-nomenklaturer tillämpas".

Förfarande

HGNC kontaktar författare som har publicerat om den mänskliga genen i fråga via e-post. De tillfrågas om sin åsikt om den föreslagna nomenklaturen. HGNC samarbetar också med andra databaskonservatorer och experter för specifika genfamiljer eller genuppsättningar.

Revidering

Att ändra ett standardiserat gennamn efter att det har etablerats kan skapa förvirring. Fördelen med sådana ändringar är därför kontroversiell. Därför ändrar HGNC ett gennamn endast om de flesta forskare som arbetar med genen kan godkänna ändringen.

Relaterade sidor

Organisationen för humangenom (HUGO)
Det mänskliga genomprojektet
mänskligt genom
gen
Gen-nomenklatur.

Frågor och svar

F: Vilken roll har HUGO Gene Nomenclature Committee (HGNC)?

S: HGNC fastställer ett unikt och meningsfullt namn för varje känd mänsklig gen.

F: Hur väljer HGNC namn på gener?

S: HGNC frågar experter om deras åsikter innan de ger varje gen ett långt namn och en förkortning.

F: Vad är förkortningen för det namn som HGNC ger varje gen?

S: Förkortningen kallas för en symbol.

F: Varför är traditionella gennamn och förkortningar inte specifika för en enda gen?

S: Traditionella gennamn och förkortningar kan användas för att hänvisa till flera olika gener, vilket leder till förvirring.

F: Hur många gensymboler ges varje gen av HGNC?

S: HGNC:s korta gennamn, eller gensymboler, ges endast till en gen.

F: Vad är fördelen med att använda HGNC:s gensymboler i stället för traditionella gennamn?

S: Genom att använda HGNC:s gensymboler minskar förvirringen om vilken gen som avses.

F: Vilken organisation är HGNC en del av?

S: HGNC är en del av Human Genome Organisation (HUGO).