HGNC: HUGO:s kommitté för unika namn och symboler för mänskliga gener

HGNC (HUGO) standardiserar unika, tydliga namn och symboler för mänskliga gener — minskar förväxlingar och säkerställer global konsistens i genetikforskning.

Författare: Leandro Alegsa

HUGO Gene Nomenclature Committee (HGNC) fastställer ett unikt och meningsfullt namn för varje känd mänsklig gen. Kommittén frågar experter inom respektive område om deras åsikter, dokumenterar förslagen och publicerar godkända namn i sin databas. HGNC ger varje gen ett fullständigt namn och en förkortning (en symbol). HGNC är en del av Human Genome Organisation (HUGO) och arbetar för att namnstandarder ska användas av forskare, kliniker och databaser världen över.

Varför standardiserade gennamn behövs

Traditionella gennamn och förkortningar kan vara otydliga eller användas för flera olika gener. Ett tydligt exempel är CAP (som bara betyder "kromosomassocierat protein") — samma förkortning kan hänvisa till flera olika gener, till exempel BRD4, CAP1, LNPEP, PTPLA, SERPINB6 och SORBS1. När flera gener delar samma namn uppstår lätt missförstånd i forskning, kliniska rapporter och databassökningar.

Vad HGNC gör

  • Ger varje human gen en enda godkänd gensymbol och ett fullständigt namn för att undvika tvetydighet.
  • Upprätthåller en offentlig databas med godkända symboler, alternativa namn och historik över namnändringar.
  • Råder och konsulterar experter och genfamiljer för att hitta lämpliga och informativa namn.
  • Tilldelar stabila identifierare (HGNC-ID) som används för entydig länkning mellan resurser.

Riktlinjer för namn och symboler

  • Symboler är korta och lämpligen skrivna med versaler för mänskliga gener (t.ex. TP53).
  • Symboler bör undvika specialtecken, skiljetecken och onödiga siffror som kan orsaka förväxling.
  • Namn ges så att de speglar genens funktion, familjetillhörighet eller andra informativa egenskaper när det är möjligt.
  • HGNC dokumenterar alternativa och historiska namn så att äldre litteratur fortfarande kan tolkas korrekt.

Betydelse för forskning och vård

Enhetliga namn gör det enklare att söka efter information, kombinera data från olika studier och kommunicera resultat mellan laboratorier och kliniker. I kliniska sammanhang minskar entydiga symboler risken för feltolkningar i diagnosrapporter, genetisk rådgivning och läkemedelsutveckling.

Tips för användare

  • Använd alltid HGNC:s godkända symbol i publicerade arbeten och i databaser när det är möjligt.
  • Om du måste ange äldre eller alternativa namn, skriv först den godkända symbolen och lägg alternativa namn inom parentes.
  • Kontrollera regelbundet HGNC:s databas för uppdateringar — symboler kan revideras när ny kunskap tillkommer.

Genom att följa HGNC:s rekommendationer minskar man förvirring och ökar tydligheten i både grundforskning och klinisk användning av genetisk information.

Riktlinjer för namngivning

HGNC:s tillvägagångssätt för att namnge gener och tilldela symboler (gennamnsförkortningar) är:

  1. Gen-symbolerna måste vara unika.
  2. Symboler ska endast använda det romerska alfabetet och arabiska siffror.
  3. Symboler får inte innehålla interpunktion eller "G" för gen.
  4. symbolerna inte innehåller någon hänvisning till den art de är kodade i, dvs. "H/h" för människa

En fullständig beskrivning av HGNC:s riktlinjer för nomenklatur finns på deras webbplats [2]. HGNC förespråkar appendixen _v1, _v2,... för att skilja mellan olika skarvvarianter och _pr1, _pr2,... för promotorvarianter av en enskild gen.

HGNC anger också att "gen-nomenklaturen bör utvecklas i takt med ny teknik snarare än att vara restriktiv, vilket ibland sker när historiska och enskilda gen-nomenklaturer tillämpas".

Förfarande

HGNC kontaktar författare som har publicerat om den mänskliga genen i fråga via e-post. De tillfrågas om sin åsikt om den föreslagna nomenklaturen. HGNC samarbetar också med andra databaskonservatorer och experter för specifika genfamiljer eller genuppsättningar.

Revidering

Att ändra ett standardiserat gennamn efter att det har etablerats kan skapa förvirring. Fördelen med sådana ändringar är därför kontroversiell. Därför ändrar HGNC ett gennamn endast om de flesta forskare som arbetar med genen kan godkänna ändringen.

Relaterade sidor

Frågor och svar

F: Vilken roll har HUGO Gene Nomenclature Committee (HGNC)?


S: HGNC fastställer ett unikt och meningsfullt namn för varje känd mänsklig gen.

F: Hur väljer HGNC namn på gener?


S: HGNC frågar experter om deras åsikter innan de ger varje gen ett långt namn och en förkortning.

F: Vad är förkortningen för det namn som HGNC ger varje gen?


S: Förkortningen kallas för en symbol.

F: Varför är traditionella gennamn och förkortningar inte specifika för en enda gen?


S: Traditionella gennamn och förkortningar kan användas för att hänvisa till flera olika gener, vilket leder till förvirring.

F: Hur många gensymboler ges varje gen av HGNC?


S: HGNC:s korta gennamn, eller gensymboler, ges endast till en gen.

F: Vad är fördelen med att använda HGNC:s gensymboler i stället för traditionella gennamn?


S: Genom att använda HGNC:s gensymboler minskar förvirringen om vilken gen som avses.

F: Vilken organisation är HGNC en del av?


S: HGNC är en del av Human Genome Organisation (HUGO).


Sök
AlegsaOnline.com - 2020 / 2025 - License CC3