Sorai skrev många inflytelserika verk där han visade vad han ansåg vara de två grundläggande problemen i Songkonfucianismens filosofi. Det första gällde bakufu-domän-systemet, som på 1700-talet hade problem. Sorai tvivlade på att det var tillräckligt att varje person ville finna sitt etiska goda. Han hävdade att det för att lösa tidens politiska kris krävdes mer än att fullända den moraliska karaktären. Han såg också att de kinesiska vise kungarna inte bara var intresserade av moral utan också av själva styret. Den andra punkten där Sorai inte höll med Songkonfucianismen var att han ansåg att den lade för stor vikt vid moral och att den förträngde den mänskliga naturen, eftersom den mänskliga naturen var baserad på känslor.
Sorai ansåg inte att dessa två problem var problem med själva konfucianismen. Han ansåg att Songkonfucianisterna tolkade de klassiska verken i de fyra böckerna och de fem klassikerna på fel sätt. Enligt Sorai gjorde de detta eftersom de "inte kände till de gamla orden". Sorai konsulterade de gamla verken för att få mer tillförlitlig kunskap. Han hävdade att den ultimata formen av vetenskaplig kunskap var historia. För honom var dessa verk den bästa källan, även om nutiden ständigt förändrades. Sorai ansåg att studiet av filosofi började med studiet av språket. I detta var han starkt påverkad av den antika retorikskolan under Mingperioden. Denna rörelse såg Qin- och Han-perioderna som förebild för prosan och Tang-perioden som förebild för poesin. Sorai-skolan introducerade i Selections of Tang Poetry till Japan, där den blev mycket populär. Detta verk tros ha redigerats av Li Panlong (李攀竜 1514-70), som var en av grundarna av den antika retorikskolan. Som ett resultat av detta är Sorais skola idag också känd som den antika retorikskolan (kobunji 古文辞). Sorais skola såg Val av Tangpoesi främst som ett sätt att få tillgång till de fem klassikerna. I denna synvinkel skilde den sig från andra konfucianistiska skolor. Sorai skulle också anklaga andra konfucianister i Japan, såsom Hayashi Razan, för att i alltför hög grad förlita sig på Song-källor såsom Zhu Xi.
Sorai höll inte heller med om andra läror inom Songkonfucianismen. En av dem var att vägen inte var en förutbestämd princip i universum, utan snarare en inrättning av människor: de gamla vise hade beskrivit den i konfucianismens klassiska verk. Dessa föreskrev Vägen, som var uppdelad i riter (rei 礼) och musik (gaku 楽). Riterna gav social ordning och musiken gav inspiration till hjärtat. På så sätt möjliggjorde den direkt flödet av mänskliga känslor, något som Songkonfucianismens moralistiska filosofi inte höll med om. Sorai argumenterade för motsatsen och ville att människor skulle berikas genom musik och poesi. Han lärde ut att litteraturen borde vårdas, eftersom den var en viktig del av det mänskliga uttrycket. Som ett resultat av detta började kinesisk skrift blomstra i Japan och blev en accepterad konstform. På så sätt var flera stora författare av kinesisk komposition från den tiden anhängare av hans skola.
Sorai var en anhängare av samurajklassen. Medan de flesta gamla institutioner går under på grund av ledarskapsproblem, ansåg han att samurajerna var bäst lämpade att lösa detta problem med ett system av belöningar och bestraffningar. Sorai såg också problem med köpmannaklassen på den tiden: han anklagade dem för att konspirera för att låsa priserna. Han stödde dock inte heller de lägre klasserna. Han hävdade: "Vad kan det finnas för värde för vanligt folk att överskrida sin rätta ställning i livet och studera sådana böcker [som de konfucianska klassikerna]?".
Mästare Sorais undervisning
Master Sorai's Teachings är en dokumentation av Sorais undervisning och hans utbyte med sina elever. Texten redigerades av hans egna elever och innehåller deras frågor följt av hans svar. Verket gavs inte ut förrän 1724, men man tror att det faktiskt skrevs omkring 1720. I den skriver han att litteraturen inte så mycket är avsedd för undervisning i moral eller styrning, utan att den helt enkelt låter människans känslor flöda. Utifrån detta kan svaren på de tidigare ämnena hittas. Även om Sorai försökte omdefiniera källorna till Tokugawas legitimitet var hans syfte helt klart att stärka Tokugawa-shogunatets auktoritet.
