Willem Kes (16 februari 1856 i Dordrecht - 22 februari 1934 i München) var en nederländsk dirigent. Han var den förste dirigenten för Concertgebouworkestern (numera Kungliga Concertgebouworkestern).
Kes lärde sig violin och studerade för den berömde Joseph Joachim i Berlin. Från 1876 inledde han sin karriär som dirigent. När Concertgebouworkestern startades i Amsterdam 1888 var Kes dess dirigent. Han gjorde det till en bra orkester. Han hade detta jobb fram till 1895 då Willem Mengelberg tog över. Kes åkte till Glasgow för att dirigera den skotska orkestern. År 1898 tog han ett dirigentjobb i Moskva. Från 1905 till 1926 var Kes chef för ett musikkonservatorium (högskola) i Koblenz. Han arbetade även i Dresden.