Candidatus
Candidatus är en term inom taxonomin (vetenskaplig klassificering) av bakterier.
Det är en etikett som sätts framför namnet på en bakterie som inte kan odlas på en agarplatta eller i någon annan bakteriologisk kultur. Ett exempel är "Candidatus Phytoplasma allocasuarinae". Candidatusstatus kan användas när en art eller ett släkte är väl studerat men inte kan odlas. Numera får man mycket information genom sekvensanalys av 16S ribosomalt RNA.
Historia
För att en art ska kunna publiceras korrekt måste bakterierna isoleras, odlas, beskrivas och deponeras i en bakteriologisk kultursamling. Vissa bakterier kräver dock särskilda vävnadskulturförhållanden och kan inte hållas i bakteriologiska kultursamlingar. Detta gäller även bakterier som lever inuti andra organismer eller celler. Dessa inkluderar obligat intracellulära patogener och endosymbionter, insektssymbionter och populationer från hav eller slam.
År 1994 publicerade Murray och Schleifer en taxonomisk not. De rekommenderade att den nya kategorin med obestämd rang (Candidatus) skulle inrättas för vissa förmodade taxa som inte kunde beskrivas tillräckligt detaljerat för att motivera inrättandet av ett nytt taxon. De rekommenderade också att en Candidatus-lista skulle upprättas i International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology.
Enligt "IRPCM Phytoplasma/Spiroplasma Working Team - Phytoplasma taxonomy group" ska förkortningen för Candidatus vara Ca.
Frågor och svar
F: Vad är Candidatus?
S: Candidatus är en term som används inom bakterietaxonomin och avser en etikett som sätts framför namnet på en bakterie som inte kan odlas i någon annan bakteriologisk kultur.
F: Vad är syftet med att använda Candidatus?
S: Candidatus-status används när en art eller ett släkte är väl studerat men inte kan odlas.
F: Kan man ge ett exempel på Candidatus?
S: Ja, ett exempel på Candidatus är "Candidatus Phytoplasma allocasuarinae."
F: Varför kan vissa bakterier inte odlas?
S: Vissa bakterier kan inte odlas eftersom de inte kan växa på en agarplatta eller i någon annan bakteriologisk odling.
F: Hur får man mycket information om bakterier nuförtiden?
S: Mycket information om bakterier erhålls genom sekvensanalys av 16S ribosomalt RNA.
F: Används Candidatus för bakterier som inte har studerats särskilt ingående?
S: Nej, Candidatus används för bakterier som har studerats väl men som inte kan odlas.
F: Är Candidatus exklusivt för bakterier?
S: Ja, Candidatus är en term som uteslutande används inom taxonomin för bakterier.
