Dakotafolket bodde i Wisconsin och Minnesota på 1600-talet. År 1700 hade en del av dem flyttat till nuvarande South Dakota. I slutet av 1600-talet ingick Dakota allianser med franska handelsmän. Fransmännen försökte använda denna allians för att hjälpa dem att kontrollera den nordamerikanska pälshandeln mot engelsmännen.
Dakotakriget 1862
I slutet av 1850-talet ledde USA:s fördragsbrott och orättvisa utbetalningar från indianagenterna (personer från regeringen som fick umgås med de infödda) till ökad hunger och svårigheter för Dakotafolket. Även om Dakota försökte förhandla med den amerikanska regeringen lyckades ingenting. Den 16 augusti 1862 dödade en grupp Dakotajägare en familj med nybyggare. Detta ledde till fler attacker mot bosättare och snart hade ett fullt krig börjat. Den 5 november 1862 dömdes 38 Dakotakrigare till döden genom hängning. Detta skulle senare bli den största massavrättningen i USA:s historia.
Under och efter revolten lämnade många Eastern Dakota och deras familjer Minnesota och Eastern Dakota för att åka till Kanada eller bosätta sig i James River Valley i ett kortvarigt reservat. De tvingades sedan flytta till Crow Creek-reservatet på Missouriflodens östra strand. Några anslöt sig till Western Dakota och flyttade längre västerut för att hjälpa Lakotastammarna att fortsätta sin kamp mot den amerikanska militären.
Andra stannade kvar i Minnesota och österut, i små reservat som fortfarande finns kvar, bland annat i Sisseton-Wahpeton-, Flandreau- och Devils Lake-reservaten (Spirit Lake eller Fort Totten) i Dakota. Några flyttade till Nebraska, där Santee Sioux Tribe idag har ett reservat på Missouriflodens södra strand.
De som flydde till Kanada lämnade nio små reservat för sina familjer i Manitoba (Sioux Valley, Long Plain, Dakota Tipi, Birdtail Creek och Oak Lake [Pipestone]) och ytterligare fyra (Standing Buffalo, Moose Woods [White Cap], Round Plain [Wahpeton] och Wood Mountain) i Saskatchewan.