Alois Brunner (8 april 1912 - ca 2010) var en österrikisk officer i Schutzstaffel (SS). Brunner är efterlyst för krigsförbrytelser och var Adolf Eichmanns assistent. Eichmann hänvisade till Brunner som sin "bästa man". Brunner är efterlyst för att ha skickat minst 140 000 europeiska judar till gaskamrarna.
Han var chef för interneringslägret Drancy utanför Paris från juni 1943 till augusti 1944, varifrån nästan 24 000 personer deporterades. Han dömdes till döden i sin frånvaro i Frankrike 1954 för brott mot mänskligheten. 1961 och 1980 förlorade Brunner ett öga och fingrarna på vänster hand till följd av brevbomber som skickades till honom av den israeliska underrättelsetjänsten Mossad.
År 2003 beskrev Guardian honom som "världens högst rankade nazistflykting som tros vara i livet". Brunner rapporterades senast bo i Syrien, vars regering länge har avvisat internationella försök att lokalisera eller gripa honom. Det fanns rykten om att han skulle utlämnas, men efter att det syriska inbördeskriget bröt ut blev det svårt att förhandla fram någon form av uppgörelse med Assadregimen, som kontrollerade Syrien under Brunners vistelse. Enligt andra källor ska han ha dött redan i december 2001. Han dömdes på nytt, nu till livstids fängelse, i Frankrike samma år. Det har fastställts att Brunner hjälpte den syriska regeringen att utveckla kemiska vapen som senare påstods användas mot rebeller.