Det mest uppenbara kännetecknet för Ankylosaurus är dess pansar, som består av massiva knölar och benplattor, så kallade osteodermer eller beniga skutor, som är inbäddade i huden. Osteodermer finns också i huden hos krokodiler, bältdjur och vissa ödlor. Benet överlagrades troligen av ett segt, hornigt lager keratin.
Dessa osteodermer varierade mycket i storlek, från breda, platta plattor till små, runda knölar. Plattorna låg i regelbundna horisontella rader längs djurets nacke, rygg och höfter, och de många mindre knölarna skyddade områdena mellan de stora plattorna. Mindre plattor kan ha varit anordnade på lemmarna och svansen. Jämfört med den något äldre ankylosauriden Euoplocephalus var plattorna hos Ankylosaurus släta i strukturen, utan de höga kölar som finns på pansaret hos den samtida nodosauriden Edmontonia. En rad platta, triangulära spikar kan ha skjutit ut lateralt längs varje sida av svansen. Hårda, rundade fjäll skyddade toppen av skallen, medan fyra stora pyramidformade horn sköt ut från de bakre hörnen.
Under den var den täckt av normal hud, men för att komma åt den måste köttätaren vända på ett djur som väger upp till 6 000 kg.