Kritiken mot buddhismen är ungefär som kritiken mot alla andra religioner. Den görs främst av människor som inte håller med om vad religionen säger och vad den tror på. Kritiken kommer ofta från agnostiker, skeptiker, materialistisk filosofi, människor som följer andra religioner eller från buddhister som vill ha förändring.
Kritiken omfattar vissa trosuppfattningar som endast finns i vissa buddhistiska kulturer och institutioner. Dessa är inte alla trogna de ursprungliga buddhistiska principerna. Sam Harris, en anhängare av New Atheism, och troende på buddhistisk meditation säger att många anhängare av buddhismen behandlar den som en religion på fel sätt. De säger att deras tro ofta är "naiv, petitionär och vidskeplig". ("Petitioner" betyder att man gör en petition eller en begäran, som när man ber om hjälp). De anser att detta hindrar anhängarna från att leva enligt de sanna buddhistiska principerna.
Vissa kritiker säger att buddhistiska anhängare och ledare har varit intresserade av egendom och pengar. De anser att de är korrupta och att de är mer intresserade av rikedom och makt än av buddhistiska principer. Det har förekommit många sexskandaler med lärare i västerländska buddhistiska grupper.
Michael Jerryson anser att buddhismen har varit kopplad till regeringen ända sedan dess början. Han menar att oförmågan att förstå tanken på ett land utan buddhism leder till en slags religiös nationalism. Han anser att detta återfinns i många buddhistiska konflikter. I det medeltida Sydostasien fanns det många buddhistiska stater. Dessa omfattade bland annat Pagan Kingdom, Sukhothai Kingdom och kungariket Polonnaruwa. I Sri Lanka deltog moderna munkar ofta i landets politik. De gjorde detta trots att Buddha endast trodde på att hjälpa andra att göra sina egna val i regeringen. Fredsaktivister som A. T. Ariyaratne har också använt sig av buddhismen för sätt att göra saker och ting.
Östasiatiska mahayana-buddhister får också ofta pengar från staten. Zenprästen Brian Daizen Victoria skrev i sin bok Zen at War att buddhistiska grupper rättfärdigade den japanska militarismen. Han sade att de hjälpte den japanska armén på slagfältet. På grund av boken bad flera grupper om ursäkt för sina handlingar.
Efter 2008 års problem i det tibetanska området i Kina hävdade Kina att Dalai Lama bidrog till att skapa problemen och våldet. En kinesisk talesman sade att ett stort antal vapen och sprängämnen hade hittats i kloster i Tibets huvudstad.
Buddhismen har kritiserats för att den behandlar kvinnor sämre än män. Detta gäller främst kvinnliga munkar. De flesta buddhistiska skolor har fler regler för bhikshuni (nunnor) än bikshu (munkar). Buddhister säger att på Buddhas tid hade nunnorna fler problem som deras säkerhet. Munkarna reste ofta i skogen och mellan städerna. På grund av detta skapades fler regler för nunnor, till exempel: nunnor får inte resa ensamma.
Vid kongressen i Hamburg 2007 sade Dalai Lama att män och kvinnor har samma rättigheter, men att kulturen ibland påverkar hur saker och ting görs.