Den 7 februari 1990 tvingades SUKP:s centralkommitté att lätta på sin kontroll över makten. Ungefär samtidigt började olika "republiker" i Sovjetunionen hävda sin rätt att bli självständiga. De slutade att följa lagarna från Sovjetunionens centralregering. De slutade också att betala skatt till Sovjetunionens centrala myndigheter (i Moskva). Detta försvagade den sovjetiska myndigheten och ekonomin.
Under Gorbatjovs besök 1990 i Vilnius, Litauens huvudstad, protesterade omkring 250 000 personer vid ett offentligt möte. Den 11 mars 1990 förklarade Litauens ledare sin självständighet från Sovjetunionen. Den sovjetiska centralregeringen krävde dock att Litauen skulle ge upp sin självständighet och skickade den sovjetiska armén som fortsatte att ha många trupper i Litauen. Regeringen sade att den måste följa den sovjetiska konstitutionen om den ville lämna landet. Sovjetunionen genomförde också en ekonomisk blockad av Litauen. Estland och Lettland intogs också olagligt av Sovjetunionen 1940. Den 30 mars 1990 förklarade Estlands ledare att Sovjetunionens kontroll av deras land från 1940 var olaglig. De förklarade sig också självständiga. Lettlands ledare inledde också självständighetsprocessen den 4 maj 1990.
Den 17 mars 1991 röstade folket i Sovjetunionen för att behålla det nuvarande Sovjetunionen i en något förändrad form. De baltiska staterna (Litauen, Estland, Lettland), Armenien, Georgien och Moldavien bojkottade omröstningen. I var och en av de övriga nio "republikerna" i Sovjetunionen stödde en majoritet av väljarna att behålla Sovjetunionen. I juni 1991 hölls ett val i Ryska republiken Sovjetunionen. Boris Jeltsin fick 57 procent av rösterna. Han var en kritiker av Michail Gorbatjov. Gorbatjovs favoritkandidat, den tidigare premiärministern Nikolaj Ryzjkov, fick endast 16 procent av rösterna.
Kuppen
Sovjetunionens "republiker" hade den 20 augusti 1991 gått med på att underteckna ett avtal som gjorde dem till nästan självständiga republiker men del av en federation, med en gemensam president, utrikespolitik och militär. Många personer var dock oense och ville ha en snabb övergång till marknadsekonomi även om det innebar Sovjetunionens upplösning. Det fanns många andra inom SUKP och Sovjetunionens militär som stödde en fortsättning av Sovjetunionen.
Den 19 augusti 1991 bildade några höga ledare i Sovjetunionen en "statskommitté för det statliga nödläget". De förhindrade undertecknandet av det ovannämnda avtalet den 20 augusti 1991. Bland dessa ledare fanns Gorbatjovs vicepresident Gennadi Janayev, premiärminister Valentin Pavlov, försvarsminister Dmitriy Yazov, KGB-chefen Vladimir Kryuchkov och många andra höga tjänstemän. Vid den tiden semestrade Gorbatjov på Krim). Dessa tjänstemän satte honom i husarrest. De utfärdade också order som förbjöd all politisk verksamhet och förbjöd de flesta tidningar.
Detta var som en kupp. Organisatörerna hade förväntat sig folkligt stöd för sin aktion. Men folket stödde dem inte. I stället stödde de "Vita huset" (Jeltsins kontor), som då var den ryska suveränitetens symboliska säte. Kuppens organisatörer försökte men misslyckades med att gripa Boris Jeltsin. Efter tre dagar, den 21 augusti, misslyckades kuppen. Myndigheterna häktade organisatörerna. Gorbatjov återvände som Sovjetunionens president. Gorbatjovs reella befogenheter hade dock minskat.
Under hösten 1991 tog den ryska regeringen över unionsregeringen, ministerium för ministerium. I november 1991 utfärdade Jeltsin en order som förbjöd SUKP i hela den ryska republiken. Som ett resultat av detta lämnade många före detta SUKP-anställda SUKP för att gå in på de nya positionerna i den nya ryska regeringen.
Efter att kuppen misslyckades ökade Sovjetunionens republiker sina ansträngningar att bli självständiga. Den 6 september 1991 erkände Sovjetunionen Estlands, Lettlands och Litauens självständighet. Den 1 december 1991 förklarade Ukraina sin självständighet, efter att 90 % av väljarna valt ett självständigt Ukraina; detta förstörde verkligen alla förhoppningar om att hålla ihop Sovjetunionen eftersom Ukraina var den näst mäktigaste "republiken" efter Ryssland. En efter en förklarade sig också de återstående elva "republikerna" i Sovjetunionen som suveräna och oberoende stater.
CIS
Som nämnts ovan hade Sovjetunionen den 6 september 1991 erkänt Estlands, Lettlands och Litauens självständighet. Det kan noteras att tolv av Sovjetunionens femton republiker hade undertecknat ett internationellt avtal (Europeiska energistadgan) i Haag den 17 december 1991. Undertecknandet visade att dessa republiker praktiskt taget hade blivit självständiga och suveräna länder.
Med undantag för de redan självständiga Estland, Lettland och Litauen anslöt sig de återstående 12 republikerna (utom Georgien) till Oberoende staters samvälde (OSS). I december 1993 anslöt sig även Georgien till OSS. Den 26 augusti 2006 lämnade Turkmenistan det permanenta medlemskapet och blev associerad medlem.
Många trodde att Sovjetunionen upphörde att existera i och med bildandet av Oberoende staters samvälde (CIS). De trodde att det var Sovjetunionens upplösning. Många andra tror att Ryssland i och med OSS fortsätter att ha viss kontroll över de före detta republikerna i Sovjetunionen.
Den 25 december 1991 avgick Gorbatjov som president för Sovjetunionen. Den 31 december 1991 hade alla officiella sovjetiska institutioner upphört att fungera i de olika "republikerna" i Sovjetunionen. De enskilda regeringarna i dessa republiker började fungera. Den sovjetiska flaggan vajade sista gången över Kreml.