Orkansäsongen 2006 i Atlanten var en årlig händelse i den årliga cykeln av tropiska cykloner. Den började officiellt den 1 juni 2006 och varade till den 30 november 2006. Tio tropiska stormar bildades under säsongen. Fem blev orkaner och en tropisk storm fick inget namn. Den påverkade USA:s delstat Florida

Den här säsongen var ovanlig eftersom inga orkaner nådde land i USA. En tropisk storm, den tropiska stormen Zeta från säsongen 2005, fortsatte in i januari, vilket var den andra gången som en tropisk cyklon förekom under två kalenderår.

På grund av den superaktiva säsongen 2005 trodde prognoserna och meteorologerna att säsongen 2006 också skulle bli mycket aktiv, men inte lika aktiv som 2005. El Niño i kombination med förekomsten av det sahariska luftskiktet över den tropiska Atlanten bidrog dock till en långsam säsong och tvingade alla tropiska cykloner att försvinna efter den 2 oktober.