Bruckners far var organist och skolmästare i en liten by i Österrike. Vid fyra års ålder visade Bruckner musikalisk talang. Han spelade psalmmelodier på en liten violin och hittade sedan ackorden till dem på familjens spinet. När han var tio år gammal spelade han ibland på byns orgel vid gudstjänster. Efter faderns död 1837 blev han körpojke vid klosterskolan i Sankt Florian där han 1848 blev organist i klosterkyrkan. Han började komponera vid denna tid och skrev ett Requiem i d-moll. Han gillade Schuberts och Mendelssohns musik och de påverkade hans sätt att komponera.
Även om han trivdes bra på St Florian sa hans vänner att han borde leta efter ett bättre jobb. De fick honom att söka organistjobbet vid katedralen i Linz, vilket han fick med lätthet. Under tiden försökte han lära sig mer om harmoni och gick en kurs hos den berömde läraren Simon Sechter. Därefter tog han en kurs i orkestrering med läraren Otto Kitzler. Han blev mycket intresserad av musik av romantiska kompositörer som Liszt, Berlioz och framför allt Wagner. År 1864 skrev han en mässa i d-moll för kör och orkester som tydligt visade på Wagners inflytande. År 1866 avslutade han den första av sina nio symfonier. Han skrev också några mycket vackra motetter som hör till 1800-talets bästa musik skriven för den romersk-katolska kyrkan.
År 1866 tillbringade han tre månader på ett sanatorium efter ett nervöst sammanbrott. Under sina senare år led han ofta av depression.
År 1868 blev han professor vid Wiens konservatorium där han undervisade i harmoni och kontrapunkt. Detta var ett utmärkt arbete. De sista 25 åren av sitt liv ägnade han sin tid åt att undervisa och komponera sina symfonier. Han reste också och gav orgelkonserter i Notre Dame i Paris och i Royal Albert Hall och Crystal Palace i London.
Hans musik var mycket modern för sin tid och en del människor, däribland den berömda musikkritikern Eduard Hanslick, tyckte inte om den. Hanslick sade att Bruckner komponerade som Wagner, men även om Bruckner hade lärt sig av Wagner kopierade han honom inte bara. Bruckners musik visar sin egen starka personlighet. Hanslick, som föredrog Brahms symfonier, gjorde Bruckner mycket illa genom att skriva dåliga recensioner av hans musik. Han var dekanus för musikinstitutionen vid universitetet i Wien och ville inte att Bruckner skulle utnämnas till docent vid universitetet. Bruckner fick dock det jobbet 1875. Han blev mer och mer berömd, särskilt efter att den store dirigenten Arthur Nikisch dirigerade uruppförandet av hans Symfoni nr 7 i Leipzigs Gewandhaus 1884. Han fick många utmärkelser. Vid sin död hade han ännu inte avslutat sin symfoni nr 9. Han begravdes i St Florian.