En hel typ av kemi, som kallas organisk kemi, handlar om kol och dess föreningar. Kol bildar många olika typer av föreningar. Kolväten är molekyler med kol och väte. Metan, propan och många andra bränslen är kolväten. Många av de ämnen som människor använder dagligen är organiska föreningar.
Kol, väte, kväve, syre och vissa andra grundämnen som svavel och fosfor bildar tillsammans det mesta av livet på jorden (se Förteckning över biologiskt viktiga grundämnen). Kolet bildar ett mycket stort antal organiska föreningar eftersom det kan bilda starka bindningar med sig självt och med andra grundämnen. På grund av den mängd kol som levande organismer har anses alla organiska saker vara "kolbaserade".
Varje kolatom bildar vanligtvis fyra kemiska bindningar, som är starka förbindelser med andra atomer för att bilda molekyler. Den typ av bindning som kolet gör kallas kovalenta bindningar. Dessa bindningar gör att kolet kan bilda många olika typer av små och stora molekyler. En metanmolekyl är den minsta; den har fyra väteatomer bundna till kol. Bindningarna kan vara dubbelbindningar, vilket innebär att två bindningar bildas mellan kol och en annan atom för att skapa en starkare förbindelse. Koldioxid har till exempel två syreatomer, och var och en av dem är dubbelbunden till kol. Kol kan även bilda tre bindningar med en annan atom, vilket kallas för en trippelbindning. I gasen acetylen bildar kolet till exempel en trippelbindning med en annan kolatom.
Genom att binda till andra kolatomer kan kol bilda långa kedjeformade molekyler, så kallade polymerer, som till exempel plast och proteiner. Atomer av andra grundämnen kan ingå i de långa polymerkedjorna, ofta kväve eller syre.
Rent kol bildar diamant genom att binda sig till fyra andra kolatomer i en tredimensionell kristall. Det bildar grafit genom att binda till tre andra kolatomer för att bilda tunna platta lager.