I en moské ska man fokusera på att dyrka Allah. Därför finns det ett antal regler om hur man ska bete sig i en moské. En del av dessa regler är desamma över hela världen, till exempel att man inte får ha några skor på sig i bönehallen. Andra regler är olika från moské till moské.
Bönledare
Det anses i allmänhet vara bra att ha någon som leder bönerna, även om det inte är nödvändigt. Den person som vanligtvis leder bönerna kallas imam. Han måste vara en fri och ärlig man. Han bör också vara en auktoritet när det gäller att svara på frågor om religion. I moskéer som byggts eller upprätthålls av regeringen väljs imamen ut av härskaren. I privata moskéer väljer samhället imamen genom majoritetsomröstning.
Endast män får leda böner för män. Kvinnor får leda böner för församlingar där det bara finns kvinnor.
Besök i en moské
Förutom tvättning finns det andra regler som gäller för dem som går in i moskén, även om de inte vill be där. Det är förbjudet att ha skor på sig i bönehallens mattbelagda område. Vissa moskéer tillåter inte heller att man bär skor i andra delar, även om dessa kanske inte är avsedda för bön.
Islam kräver att de troende bär kläder som visar på blygsamhet. Därför måste både män och kvinnor följa denna regel när de besöker en moské (även om moskéerna inte alltid tillämpar reglerna). Män ska komma till moskén i lösa och rena kläder som inte visar kroppens form. På samma sätt förväntas kvinnor som kommer till moskén bära lösa kläder, skjortor, byxor som täcker handlederna och vristerna och täcker huvudet, till exempel med en hijab. Många muslimer, oavsett etnisk bakgrund, bär kläder från Mellanöstern som förknippas med arabisk islam vid speciella tillfällen och böner i moskéer.
Moskéer är gudstjänstlokaler. Därför bör de som befinner sig i moskén visa respekt för dem som ber. Det är förbjudet att prata högt eller diskutera ämnen som kan vara respektlösa i områden där människor ber. Det betraktas också som ohyfsat att gå framför muslimer som ber eller på annat sätt störa dem.
Män och kvinnor ber i olika delar
Enligt islamisk lag ska män och kvinnor vara åtskilda i bönehallen. Helst ska kvinnor be bakom männen. Den andra kalifen Umar hindrade vid ett tillfälle kvinnor från att gå i moskéer, särskilt på natten, eftersom han var rädd för att de skulle bli retade av männen, så han tvingade dem att be hemma. Ibland var en särskild del av moskén avspärrad för kvinnor; till exempel lät guvernören i Mecka 870 binda rep mellan pelarna för att göra en separat plats för kvinnor.
I många moskéer i dag placeras kvinnorna bakom en barriär, en skiljevägg eller i ett annat rum. I moskéer i Syd- och Sydostasien placeras män och kvinnor i separata rum, eftersom dessa uppdelningar byggdes in i dem för flera hundra år sedan. I nästan två tredjedelar av de amerikanska moskéerna ber kvinnorna bakom skiljeväggar eller i separata utrymmen, inte i huvudbönsalen; vissa moskéer släpper inte in kvinnor alls. Även om det finns sektioner endast för kvinnor och barn är den stora moskén i Mecka inte könsindelad.
Icke-muslimer i moskéer
Ett fåtal forskare i islamisk lag anser att icke-muslimer kan tillåtas komma in i moskéer, så länge de inte sover eller äter där. Anhängare av Maliki-skolan i islamisk rättspraxis är oense om detta. De menar att icke-muslimer inte får komma in i moskéer överhuvudtaget.
Olika länder har olika åsikter om frågan. Nästan alla moskéer på den arabiska halvön och i Marocko tillåter inte icke-muslimer. Hassan II-moskén i Casablanca är en av endast två moskéer i Marocko som för närvarande är öppna för icke-muslimer.
I dagens Saudiarabien är den stora moskén och hela Mecka endast öppna för muslimer. På samma sätt är Masjid al-Nabawi och staden Medina som omger den också förbjudna för dem som inte praktiserar islam. När det gäller moskéer i andra områden har man oftast utgått från att icke-muslimer endast får gå in i moskéer om de har fått tillstånd av muslimer och om de har en giltig anledning.
I det moderna Turkiet får icke-muslimska turister gå in i alla moskéer, men de måste följa reglerna för anständighet. Besök i en moské är endast tillåtet mellan bönerna, besökare måste bära långa byxor och ta av sig skorna, kvinnor måste täcka huvudet, inga foton och högt prat är inte tillåtet. Inga hänvisningar till andra religioner är tillåtna (inga kors på halsband, inga korsgester etc.).
Men det finns också många andra platser i västvärlden och i den islamiska världen där icke-muslimer är välkomna in i moskéer. De flesta moskéer i USA rapporterar till exempel att de tar emot icke-muslimska besökare varje månad. Många moskéer i USA välkomnar icke-muslimer som ett tecken på öppenhet mot resten av samhället och för att uppmuntra till konversion till islam.
Hundar
Hundar är vanligtvis förbjudna att gå in i moskéer, men den 24 september 2008 fattade det muslimska lagrådet i Storbritannien ett särskilt beslut, en så kallad fatwa, som gav en blind muslim tillstånd att ta med sig sin ledarhund in i moskén.